El poble es localitza en una guelta o oasi, el qual reté aigua de pluja durant llargs períodes. Va ser un campament dels nòmades sahrauís de la zona durant centenars d'anys.
Història
Funcionava com una de les fortaleses militars més importants per als indígenes de les guerrilles del Front Polisario després de la retirada d'Espanya del que era llavors Sàhara Espanyol en 1976. Quan Marroc i Mauritània van assegurar el control sobre l'antiga colònia espanyola des del nord i el sud d'acord amb l'Acord tripartit de Madrid, Guelta Zemmur va servir com un punt de parada per als refugiats que anaven camí als campaments de refugiats sahrauís a Tindouf (Algèria).
Durant la guerra de 1975-1991 entre el Polisario i el Marroc, va haver-hi diverses batalles pel control de Guelta Zemmur, les més importants van tenir lloc del 24 al 27 de març i el 13 d'octubre de 1981.[2] En l'actualitat, la ciutat està controlat pel Marroc com a part del que reclama com les seves Províncies Meridionals, però el seu estatus definitiu està encara per determinar. En l'actualitat manté una base militar marroquina, amb un centre satèl·lit de comunicacions, i les àrees al voltant de la ciutat (que està prop del Mur marroquí) estan plagades de mines.
La ciutat és el lloc de naixement de Mohammed Daddach, que era el pres polític que més temps porta pres al Marroc.