La Fase de Classificació de la Copa del Món de Rugbi 1999 hi van participar 65 països en cerca de 16 places per anar a la Copa del Món de Rugbi 1999. En aquesta edició tan sols 4 equips tindrien la plaça de forma automàtica: Sud-àfrica, Nova Zelanda i França per la seva classificació a la darrera edició i Gal·les com a amfitrió. Per primera vegada, també s'introduïria el sistema de repesca.[1][2][3]