El seu pare va ser assassinat quan ella tenia cinc mesos d'edat, el 14 de maig de 1610, i la seva mare va ser desterrada de la Cort el 1617 Pel seu matrimoni amb el rei Carles I, va esdevenir reina consort d'Anglaterra, Escòcia i Irlanda, fins que va ser deposada del títol després de l'execució del seu marit, el 30 de gener de 1649. De fet, per la seva religió catòlica no va poder ser coronada reina al mateix moment que ho era el seu marit. Enriqueta Maria va conèixer el príncep de Gal·les quan aquest tornava d'Espanya on havia anat en un intent sense èxit de fer-hi un tracte matrimonial. El matrimoni no va ser ben vist per la majoria de la població anglesa, i tampoc va ser fàcil per a Enriqueta Maria la relació amb el seu marit i amb la Cort. Detestava especialment l'home de confiança del rei Carles I, el duc de BuckinghamGeorge Villiers, el qual fou assassinat l'agost de 1628, probablement per ordre d'Enriqueta Maria i el seu entorn d'origen francès. Amb tot, aquest fet va facilitar la millora de relacions entre la parella.
Enriqueta Maria va contribuir a la formació de la col·lecció d'art de Carles I, encomanant pintures i altres obres d’art.
El 1642 quan esclatà el conflicte intern, entre el Parlament i la Monarquia, ella era de viatge a Europa i des d'allí va reclutar un exèrcit per a defensar la monarquia. La participació dels escocesos al costat del Parlament, va precipitar el final de la guerra. I el 1644 va fugir amb els seus fills a França, mentre el seu marit era executat el 1649.