Coronavirus humà NL63

Coronavirus humà NL63

Human coronavirus NL63
Genoma	virus d'ARN monocatenari positiu
Taxonomia
Regne	Orthornavirae
Fílum	Pisuviricota
Classe	Pisoniviricetes
Ordre	Nidovirales
Família	Coronaviridae
Gènere	Alphacoronavirus
Espècie	Human coronavirus NL63

El coronavirus humà NL63, o HCoV-NL63, és una espècie d'Alphacoronavirus, subgènere Setracovirus,^[1] identificat per primera vegada el 2003 en un nen amb bronquiolitis als Països Baixos.^[2] La infecció amb el virus s'ha confirmat a tot el món i té una associació amb molts símptomes i malalties habituals. Les malalties associades inclouen infecció de les vies respiratòries superiors de lleu a moderada, eventual infecció greu de les vies respiratòries inferiors,^[3] trastorns del sistema digestiu^[4] i bronquiolitis.^[5] El virus es troba principalment en nens petits, gent gran i persones immunodeficients amb malalties respiratòries agudes. En zones de clima temperat té un patró d'incidència estacional, com altres membres de la família Coronaviridae.^[6] Un estudi realitzat a Amsterdam va estimar la presència de HCoV-NL63 en aproximadament el 4,7% de les malalties respiratòries comunes.^[7] Altres estudis van confirmar que el virus no és un virus emergent, sinó un que circula contínuament per la població humana.

Símptomes

Els primers casos de la infecció per VHC-NL63 es van trobar en nens petits amb infeccions greus de les vies respiratòries ingressats als hospitals. Si bé la presentació clínica del virus pot ser severa, també s'ha trobat en casos lleus d'infecció respiratòria.^[8] La comorbiditat de HCoV-NL63 amb altres infeccions respiratòries ha fet que els símptomes específics del virus siguin difícils d'identificar.^[9] Un estudi de símptomes clínics en pacients amb VHC-NL63 sense infecció secundària, va informar que els símptomes més habituals eren febre, tos, rinitis, mal de gola en empassar, ronquera, bronquitis, bronquiolitis, pneumònia i crup. Un altre estudi que investigava nens amb malalties de les vies respiratòries va indicar que HCoV-NL63 es troba més freqüentment en pacients ambulatoris que en pacients hospitalitzats, cosa que suggereix que es tracta d'un virus del refredat comú similar als HCoV-229E^[10] i HCoV-OC43, els quals generalment causen símptomes menys greus.^[11] Tanmateix, una alta freqüència de crup és específica de la infecció per VHC-V-NL63. En adults, s'han descrit alguns rars casos de SDRA amb curs fatal induïda per aquest virus.^[12]

Causa

Es creu que la ruta de difusió del VHC-NL63 és la transmissió directa de persona a persona en zones molt poblades. El virus pot sobreviure fins a una setmana a fora del cos en solució aquosa a temperatura ambient i tres hores en superfícies seques.^[13] La majoria de les persones estaran infectades amb un coronavirus durant la seva vida, però algunes poblacions són més susceptibles a la VHC-NL63. Aquests grups d'individus són els nens menors de 5 anys, la gent gran i les persones immunocompromeses. Sembla que el virus té una incidència estacional,^[14] que es produeix amb més freqüència els mesos d'hivern a clima temperat. En els casos més extrems de clima tropical, el virus no té preferència cap a una temporada determinada. Molts estudis han posat de manifest la coincidència de HCoV-NL63 amb altres coronavirus humans: virus de la grip A,^[15] ortopneumovirus humà (RSV),^[16] parainfluenza virus^[17] i metapneumovirus humà (hMPV).^[18]

Mecanisme

La transmissió de HCoV-NL63 té lloc mitjançant l'expulsió de gotes de la via respiratòria, que poden ser transportades per l'aire, o a través d'un contacte personal proper i els fòmits. El virus és capaç de sobreviure fins a set dies en secrecions respiratòries i manté la seva capacitat infecciosa a temperatura ambient. El coronavirus humà NL63 empra el mateix receptor de coronavirus que el SARS-Cov per l'entrada cel·lular.^[19] Un cop el virus ha entrat a l'amfitrió, s'uneix a receptors cel·lulars utilitzant unes proteïnes anomenades espiga, similars a les que es troben al VIH-1. El virus utilitza l'enzim conversiu de l'angiotensina 2 (ACE2)^[20] com a receptor d'entrada per unir-se i entrar a les cèl·lules diana.^[19] L'entrada a la cèl·lula amfitriona es fa mitjançant la fusió cel·lular directa amb la membrana plasmàtica o la endocitosi seguida de la fusió amb la membrana. A causa de la falta d'un clon cDNA de HCoV-NL63, la investigació sobre el cicle de replicació és limitada. Com que és un virus ARN monocatenari positiu, es poden dur a terme els processos de replicació mitjançant transcripció i traducció genètiques.

Cronologia dels descobriments

Sars-corona (SARS-HCoV)

Als anys 60 van ser descoberts dos coronavirus en humans: HCoV-229E i HCoV-OC43 associats a síndromes respiratòries lleus, similars a una grip.

A partir del 2003, una infecció respiratòria aguda coneguda com a Síndrome respiratòria aguda greu (les seves sigles en anglès són S.A.R.S.) es va diagnosticar en 8422 malalts de 30 països de tot el món, deixant un balanç de 916 morts, la qual cosa representa una mitjana de letalitat d'un 11%. Es va relacionar amb un nou coronavirus al que es va denominar SARS-CoV.^[21]

El 2004 és descobert el virus HCoV-NL63. És l'espècie que s'associa amb major freqüència als trastorns respiratoris dels humans infectats pels coronavirus.

El 2005 fou descoberta una altra varietat: HCoV-HKU1.^[22]

El 2012 va ser relacionada la malaltia i mort d'unes persones a Aràbia Saudita, Catar i Jordània amb la infecció pel virus HCoV-EMC2012 (avui dia anomenat MERS-CoV). El virus afectà també a viatgers d'arreu del món provinents d'aquests països. El seu reservori, a banda del ratpenat,^[23] és el camell comú.^[24]

Descobriments recents

Recents informes d'Austràlia, Japó, Canadà, Bèlgica indiquen que el virus s'ha dispersat mundialment. Es troba principalment en la població infantil, en els ancians i en els pacients immunocompromesos amb malalties respiratòries agudes en l'hivern.

Durant uns anys es va sospitar que l'HCoV-NL63 estava implicat en la patogènia de la malaltia de Kawasaki, una vasculitis sistèmica infantil generalment aguda, causant d'aneurismes de les artèries coronàries i que és la causa més comuna de malaltia cardíaca en nens de diversos països. Avui dia, aquesta hipòtesi ha quedat abandonada.^[25]

El 2012 es va identificar en països del Golf pèrsic un nou tipus de coronavirus humà, l'hCOV-EMC,^[26] que provocà almenys 12 casos infecciosos, dels quals 5 moriren per pneumònia aguda associada a fallada renal.^[27]

El 2018 fou tipificat a la Xina, arrel d'un brot d'infeccions respiratòries infantils particularment greus localitzat a la província de Guangzhou, un nou subgenotip de coronavirus NL63 amb una major capacitat per envair les cèl·lules hostes que el virus prototípic original, gràcies a una única mutació en la seva glicoproteïna de superfície S.^[28]

A hores d'ara, se sap que l'origen de les malalties per coronavirus es zoonòtic.^[29]

Referències

1. NCBI, Taxonomy Browser. US National Library of Medicine. «Human coronavirus NL63» (en anglès) p. 2, 2018 Maig 14; ID 277944 (rev). [Consulta: 10 maig 2020].
2. van der Hoek L, Pyrc K, Jebbink MF, Vermeulen-Oost W, et al «Identification of a new human coronavirus» (en anglès). Nat Med, 2004; 10 (4), pp: 368–373. PMID: 15034574. DOI: 10.1038/nm1024. PMC: 7095789 [Consulta: 5 juliol 2020].
3. Oosterhof L, Christensen CB, Sengeløv H «Fatal lower respiratory tract disease with human corona virus NL63 in an adult haematopoietic cell transplant recipient» (en anglès). Bone Marrow Transplant, 2010 Jun; 45 (6), pp: 1115-1116. PMID: 19820731. DOI: 10.1038/bmt.2009.292. PMC: 7091800 [Consulta: 18 abril 2020].
4. Vabret A, Mourez T, Dina J, van der Hoek L, et al «Human Coronavirus NL63, France» (en anglès). Emerg Infect Dis, 2005 Ag; 11 (8), pp: 1225-1229. ISSN 1080-6059. DOI: 10.3201/eid1108.050110. PMID: 16102311 [Consulta: 21 maig 2020].
5. Abdul-Rasool S, Fielding BC «Understanding Human Coronavirus HCoV-NL63» (en anglès). Open Virol J, 2010 Maig 25; 4, pp: 76-84. PMID: 20700397. DOI: 10.2174/1874357901004010076. PMC: 2918871 [Consulta: 18 abril 2020].
6. Aldridge, RW; Lewer, D; Beale, S; Johnson, AM; et al «Seasonality and immunity to laboratory-confirmed seasonal coronaviruses (HCoV-NL63, HCoV-OC43, and HCoV-229E): results from the Flu Watch cohort study» (en anglès). Wellcome Open Res, 2020 Jun 10; 5 (52), V.1 -rev-, pàgs: 12. ISSN 2398-502X. Arxivat de l'original el 27 de juny 2020. DOI: 10.12688/wellcomeopenres.15812.1 [Consulta: 24 juny 2020]. Arxivat 27 de juny 2020 a Wayback Machine.
7. van der Hoek L, Pyrc K, Berkhout B «Human coronavirus NL63, a new respiratory virus» (en anglès). FEMS Microbiol Rev, 2006 Set; 30 (5), pp: 760-773. PMID: 16911043. DOI: 10.1111/j.1574-6976.2006.00032.x. PMC: 7109777 [Consulta: 7 abril 2020].
8. Bastien N, Robinson JL, Tse A, Lee BE, et al «Human Coronavirus NL-63 Infections in Children: a 1-Year Study» (en anglès). J Clin Microbiol, 2005 Set; 43 (9), pp: 4567-4573. PMID: 16145108. DOI: 10.1128/JCM.43.9.4567-4573.2005. PMC: 1234132 [Consulta: 7 abril 2020].
9. Fielding, BC. «Human Coronavirus NL63: A Clinically Important Virus?» (en anglès) pp: 153-159. PMID: 21366416. DOI: 10.2217/fmb.10.166. [Consulta: 5 juliol 2020].
10. Dijkman R, van der Hoek L «Human coronaviruses 229E and NL63: close yet still so far» (en anglès). J Formos Med Assoc, 2009 Abr; 108 (4), pp: 270-279. PMID: 19369173. DOI: 10.1016/S0929-6646(09)60066-8. PMC: 7135404 [Consulta: 18 abril 2020].
11. van der Hoek L & Berkhout B (2005) Preguntes sobre el New Haven coronavirus. J Infect Dis 192: 350–351.
12. Galante, O; Avni, YS; Fuchs, L; Ferster, OA; Almog, Y «Coronavirus NL63-induced Adult Respiratory Distress Syndrome» (en anglès). Am J Respir Crit Care Med, 2016 Gen 1; 193 (1), pp: 100-101. ISSN 1535-4970. DOI: 10.1164/rccm.201506-1239LE. PMID: 26720790 [Consulta: 14 juny 2020].
13. Pathogen Regulation Directorate «Human Coronavirus» (en anglès). Pathogen Safety Data Sheets: Infectious Substances, Public Health Agency of Canada, 2020; Mar 15 (rev), pàgs: 9 [Consulta: 18 abril 2020].
14. Huang, SH; Su, MC; Tien, N; Huang, CJ, et al «Epidemiology of human coronavirus NL63 infection among hospitalized patients with pneumonia in Taiwan» (en anglès). J Microbiol Immunol Infect, 2017 Des; 50 (6), pp: 763-770. ISSN 1995-9133. DOI: 10.1016/j.jmii.2015.10.008. PMID: 26746130 [Consulta: 21 maig 2020].
15. Toro Montoya, AI; Aguirre Muñoz, C «Influenza A» (en castellà). Medicina & Laboratorio, 2009; 15 (3-4), pp: 111-144. ISSN 0123-2576 [Consulta: 7 abril 2020].
16. NCBI, Taxonomy Browser. US National Library of Medicine. «Human orthopneumovirus. ID: 11250» (en anglès) p. 2, 2015 Nov 3; ID 11250 (rev). [Consulta: 7 abril 2020].
17. Henrickson, KJ «Parainfluenza viruses» (en anglès). Clin Microbiol Rev, 2003 Abr; 16 (2), pp: 242-264. PMID: 12692097. DOI: 10.1128/cmr.16.2.242-264.2003. PMC: 153148 [Consulta: 14 abril 2020].
18. Russell CJ, Penkert RR, Kim S, Hurwitz JL «Human Metapneumovirus: A Largely Unrecognized Threat to Human Health» (en anglès). Pathogens, 2020 Feb 13; 9 (2), pii: E109. ISSN 2076-0817. DOI: 10.3390/pathogens9020109. PMID: 32069879 [Consulta: 18 abril 2020].
19. Hofmann H, Pyrc K, van der Hoek L, Geier M, Berkhout B, Pohlmann S «Human coronavirus NL63 employs the severe acute respiratory syndrome coronavirus receptor for cellular entry» (en anglès). Proc Natl Acad Sci USA, 2005 Maig 31; 102 (22), pp: 7988–7993. PMID: 15897467. DOI: 10.1073/pnas.0409465102. PMC: 1142358 [Consulta: 5 juliol 2020].
20. UniProt «Angiotensin-converting enzyme 2» (en anglès). Protein knowledgebase. UniProt Consortium, 2019 Feb 26; Q9BYF1 -ACE2_HUMAN- (rev), pàgs: 20 [Consulta: 7 abril 2020].
21. Chan PK, Chan MC «Tracing the SARS-coronavirus» (en anglès). J Thorac Dis, 2013 Ag; 5 (Supl 2), pp: S118-S121. PMID: 23977431. DOI: 10.3978/j.issn.2072-1439.2013.06.19. PMC: 3747522 [Consulta: 18 abril 2020].
22. Vabret A, Dina J, Gouarin S, Petitjean J, et al «Detection of the new human coronavirus HKU1: a report of 6 cases» (en anglès). Clin Infect Dis, 2006 Mar 1; 42 (5), pp: 634-639. PMID: 16447108. DOI: 10.1086/500136. PMC: 7107802 [Consulta: 14 abril 2020].
23. Lu G, Liu D «SARS-like virus in the Middle East: a truly bat-related coronavirus causing human diseases» (en anglès). Protein Cell, 2012 Nov; 3 (11), pp: 803-805. PMID: 23143870. DOI: 10.1007/s13238-012-2811-1. PMC: 4875465 [Consulta: 10 abril 2020].
24. Sikkema RS, Farag EABA, Islam M, Atta M, et al «Global status of Middle East respiratory syndrome coronavirus in dromedary camels: a systematic review» (en anglès). Epidemiol Infect, 2019 Gen; 147, pp: e84. PMID: 30869000. DOI: 10.1017/S095026881800345X. PMC: 6518605 [Consulta: 10 abril 2020].
25. Baker SC, Shimizu C, Shike H, Garcia F, et al «Human coronavirus-NL63 infection is not associated with acute Kawasaki disease» (en anglès). Adv Exp Med Biol, 2006; 581, pp: 523-526. PMID: 17037590. DOI: 10.1007/978-0-387-33012-9_94. PMC: 2868826 [Consulta: 18 abril 2020].
26. van Boheemen S, de Graaf M, Lauber C, Bestebroer TM, et al «Genomic characterization of a newly discovered coronavirus associated with acute respiratory distress syndrome in humans» (en anglès). mBio, 2012 Nov 20; 3 (6), pii: e00473-12. PMID: 23170002. DOI: 10.1128/mBio.00473-12. PMC: 3509437 [Consulta: 18 abril 2020].
27. Chan JF, Li KS, To KK, Cheng VC, et al «Is the discovery of the novel human betacoronavirus 2c EMC/2012 (HCoV-EMC) the beginning of another SARS-like pandemic?» (en anglès). J Infect, 2012 Des; 65 (6), pp: 477-489. PMID: 23072791. DOI: 10.1016/j.jinf.2012.10.002. PMC: 7112628 [Consulta: 7 abril 2020].
28. Wang, Y; Li, X; Liu, W; Gan, M; et al «Discovery of a subgenotype of human coronavirus NL63 associated with severe lower respiratory tract infection in China, 2018» (en anglès). Emerg Microbes Infect, 2020 Gen; 9 (1), pp: 246–255. PMID: 31996093. DOI: 10.1080/22221751.2020.1717999. PMC: 7034077 [Consulta: 5 juliol 2020].
29. Ye ZW, Yuan S, Yuen KS, Fung SY, et al «Zoonotic origins of human coronaviruses» (en anglès). Int J Biol Sci, 2020 Mar 15; 16 (10), pp: 1686-1697. PMID: 32226286. DOI: 10.7150/ijbs.45472. PMC: 7098031 [Consulta: 18 abril 2020].

Bibliografia

• Pyrc, Krzysztof; Ronald, Dijkman; Deng, Lea; Jebbink, Maarten F.; et al Mosaic Structure of Human Coronavirus NL63, One Thousand Years of Evolution (en anglès). J Mol Biol, 2006 Des 15; 364 (5), pp: 964-973. PMID: 17054987. DOI 10.1016/j.jmb.2006.09.074 [Consulta: 5 juliol 2020]. 
• Jonsdottir, Hulda R.; Dijkman, Ronald. Coronaviruses and the human airway: a universal system for virus-host interaction studies (en anglès). Virol J, 2016 Feb 6; 13, pp: 24. PMID: 26852031. DOI 10.1186/s12985-016-0479-5 [Consulta: 27 abril 2020]. 
• Mayer, Karin; Nellessen, Cordula; Corinna, Hahn-Ast; Schumacher, Martin; et al. Fatal outcome of human coronavirus NL63 infection despite successful viral elimination by IFN-alpha in a patient with newly diagnosed ALL (en anglès). Eur J Haematol, 2016 Ag; 97 (2), pp: 208-210. PMID: 26854965. DOI 10.1111/ejh.12744 [Consulta: 5 juliol 2020]. 
• Weiss, Susan R. Forty years with coronaviruses (en anglès). J Exp Med, 2020 Maig 4; 217 (5), pii: e20200537. PMID: 32232339. DOI 10.1084/jem.20200537 [Consulta: 18 abril 2020]. 

Enllaços externs

• Informació del descobriment del HCoV-NL63
• Identifican un nuevo coronavirus que puede pasar de los animales a los seres humanos en repetidas ocasiones Infosalus.com; 2012 Des (en castellà)
• Where Did Viruses Come From? PBS Eons; 2018 Jun (en anglès)
• Los 7 tipos de coronavirus que infectan humanos Mingarro, I. Nationalgeographic.com; 2020 Mar (en castellà)