Era il·lustrador botànic al Jardí Reial de les Plantes Medicinals de París. Allí Joseph Pitton de Tournefort (1656–1708) li va encarregar il·lustrar els seus Elemens de Botanique (1694). Entre 1700 i 1702 acompanyà Tournefort i Andreas von Gundelsheimer a la seva expedició botànica a l'Orient Mitjà. Allà va fer dibuixos de llocs històrics i de la flora de la regió. Quan tornà a París, Aubriet continuà el seu treball amb els botànics del Jardí Reial.
El 1707 Aubriet succeí Jean Joubert (1643–1707) com a pintor botànic reial. Es jubilà l'any 1735 i va ser succeït per Françoise Basseporte (1701–1780)
(llatí) Joseph Pitton de Tournefort, Institutiones rei herbariae Vegeu per exemple el volum 2 de la 3a edició (amb addicions d'Antoine de Jussieu) de la Institutiones. Paris. Imprimerie Royale : 1719
Recueil de plantes, fleurs, fruits, oiseaux, insectes et coquillages, etc. peint en miniature sur vélin (Collection of plants, flowers, fruits, birds, insects and shellfish, etc., painted in miniature on vellum)
Papillons plantes et fleurs (Butterflies plants and flowers)
Plantes peintes à la gouache (Plants painted in gouache)
Jean-Louis De Sloover et Anne-Marie Bogaert-Damin (1999). Les Muscinées du XVIe au XIXe siècle dans les collections de la Bibliothèque universitaire Moretus Plantin, Namur, Presses universitaires de Namur, 257 p.ISBN 2-87037-270-1
