Odlukom predsjednika Republike dr. Franje Tuđmana od 12. septembra 1991. kojom je imenovao admiralaSvetu Leticu zapovjednikom, službeno je započelo ustrojavanje Hrvatske ratne mornarice osnivanjem prvih vojnih jedinica. Prvi brod u floti bio je desantno jurišni brod DJB-103 koji je otet od JNA 15. septembra 1991. dok je bio na remontu u Vela Luci.
Komanda HRM - dužnost komadanta Hrvatske ratne mornarice trenutno vrši kontraadmiral Robert Hranj. Komanda HRM-a smještena je u Splitu, u pomorskoj bazi "Lora".
»Postrojbe za razmagnetiziranje brodova« (poluotok Marjan) – Split
»Postaja za kontrolu brodskog magnetizma« (hrid Galija u cijelini) – Split
»Uvala Tatinje« (u cijelini) – Ploče
»Otok Pločica« (u cijelini s pripadajućim morskim prostorom) – Ploče
»Uvala Bačine« – Ploče
»Meja« – otok Korčula
Vojne podzemne luke
Potkop »Zagračina« – Dugi Otok
Potkop »Paprenica« – Dugi Otok
Potkop »Bukašin« – Dugi Otok
Potkop »Parja« – otok Vis
Potkop »Maslinova« (uvala Maslinova) – Otok Brač
Potkop »Smrka« (uvala Smrka) – Otok Brač
Potkop »Kruščica« (uvala Kruščica) – Otok Brač
Potkop »Sito« – otok Lastovo
Potkop »Kremena« – otok Lastovo
Potkop »Duba« – Ploče
Potkop »Brijesta« (uvala Brijesta) – Ploče
Potkop »Soline« (uvala Soline) – Ploče
Maskirni pristani (privezišta, vezovi) izgrađeni su na nenastanjenom dijelu obale i do njih uglavnom ne vode nikakve izgrađene komunikacije. Duž obale postoje 14 maskirnih pristana.