Той е син на граф Вернер I фон Хомберг (* 1254 † 6 февруари 1273) и съпругата му Кунигунда († 20 септември). Внук е на граф Херман IV фон Фробург-Хомберг (* 1230[1] † пр. 15 май 1253[2] или 15 май 1253[1]) и съпругата му ... фон Тирщайн-Хомберг, единствена дъщеря и наследница на граф Вернер III фон Хомберг (* 1316 † 30 март/22 септември 1323 † сл. 25 май 1323).
Сестра му Ида/Ита фон Хомберг († 1328) се омъжва преди 17 декември 1305 г. за граф Фридрих IV фон Тогенбург († 15 ноември 1315), господар на Вилденбург, граф на Тоненбург, от когото има двама сина.
Херман II фон Хомберг умира на 27 или 28-годишна възраст на 19 ноември 1303 г.[3] Не са известни негови потомци.
