Роден е в село Мадито (днес Еджеабат, Източна Тракия, Турция) със светското име Пайотас (Παγιώτας). Учи в Халкинската семинария с издръжката на чичо си архимандрит Гавриил, игумен на Иверския манастир. След завършването си е ръкоположен за дякон и става втори секретар на Свети Синод на Патриаршията. След това служи като архидякон в Смирненската митрополия при митрополит Василий и преподава в местното евангелско училище.[1]
Αγγελόπουλος, Αθανάσιος, Ο ελληνισμός Δοϊράνης και ο επίσκοπος Πολυανής Φώτιος Παγιώτας. Ανάτυπο, Θεσσαλονίκη, "Α.Π.Θ.", 1980 (Ангелопулос, Атанасиос. „Дойранският елинизъм и поленинският епископ Фотий Пайотас“)