В края на юли 1480 година османски флот, воден от Гедик Ахмед паша, достига до Апулия и разграбват крайбрежието около Отранто, а на 11 август превземат и града. Гедик Ахмед паша отблъсква няколко нападения срещу Отранто. Оставеният там гарнизон се задържа и след заминаването на основните османски сили за Константинопол, но през март 1481 година неаполитанските войски и папският флот успяват да превземат града.[2]
През 1537 г. градът е разграбен от известния пират на османска служба Хайредин Барбароса, наречен още „Червената брада“ по същия този белег на Фридрих Барбароса. Постепенно градът и пристанището му след отхвърлянето на османската заплаха губят значението си за сметка на съседния Бриндизи, като днес между града и остров Корфу се осъществява редовна фериботна връзка.
През 1804 г. Наполеон поставя в средновековната крепост на Отранто гарнизон, а титула Отрантски херцог получава известния Жозеф Фуше. Неговите наследници носят титлата до ХХ век.
Панорама
Панорамен изглед към пристанището на ОтрантоПанорамен поглед към Отрантската крепостПанорама към Голямото Алиминиско езеро в района на Отранто