След смъртта на нейния баща през 1564 г. Магдалена се заклева да не се омъжи и носи цял живот траурни дрехи. Тя започва основаването на кралски женски манастир в Хал. След кратко разболяване тя умира през 1590 г.
Източници
Constantin von Wurzbach: Habsburg, Magdalena. Biographisches Lexikon des Kaiserthums Oesterreich. Band 7, Verlag L. C. Zamarski, Wien 1861, S. 1.
Ludwig Rapp: Königin Magdalena von Österreich, Stifterin des königlichen Damenstiftes zu Hall in Tirol. Ein Lebensbild aus dem sechzehnten Jahrhundert. Druck und Verlag A. Wegers Buchhandlung, Brixen 1899.
Nikolaus Grass: Das Damenstift und seine Kunstdenkmäler, Haller Buch. Festschrift zur 650-Jahrfeier der Stadterhebung (Schlern-Schriften 106), Innsbruck (1953)
Linda Maria Koldau: Frauen – Musik – Kultur. Ein Handbuch zum deutschen Sprachgebiet der Frühen Neuzeit, Köln/Weimar 2005, ISBN 3-412-24505-4, S. 59 – 65. Online, Google books
Brigitta Lauro: Die Grabstätten der Habsburger. Kunstdenkmäler einer europäischen Dynastie, Wien (2007)