Той е най-малкият син на граф Йохан Фридрих Вилхелм фон Изенбург-Бюдинген-Меерхолц (1729 – 1802) и съпругата му графиня Каролина фон Залм, вилд- и Рейнграфиня в Грумбах (1734 – 1791), дъщеря на вилд- и Рейнграф Карл Валрад Вилхелм фон Залм-Грумбах, граф фон Даун (1701 – 1763) и графиня Юлиана Франциска фон Прьозинг-Лимпург (1709 – 1775).Брат е на Карл Вилхелм Лудвиг (1763 – 1832) и Луиза Христиана Елеонора (1770 – 1808) омъжена на 23 декември 1784 г. за граф Александер фон Пюклер-Лимпург (1751 – 1820).
Йозеф Фридрих умира на 14 март 1822 г. в Меерхолц и е погребан там.
Карл Фридрих фон Изенбург-Бюдинген-Меерхолц (1819 – 1900), граф на Изенбург-Бюдинген-Меерхолц, женен I. на 9 юни 1846 г. в Кастел за графиня Йохана фон Кастел-Кастел (1822 – 1863), II. на 21 ноември 1865 г. в Бюдинген за принцеса Агнес фон Изенбург-Бюдинген-Бюдинген (1843 – 1912)
Gerhard Köbler: Historisches Lexikon der deutschen Länder – Die deutschen Territorien vom Mittelalter bis zur Gegenwart, 2007, C. H. Beck, München: 1988, ISBN 978-3-406-54986-1. Isenburg-Büdingen-Meerholz S. 313 Digitalisat
Detlev Schwennicke, Europaische Stammtafeln, New Series, Vol. XVII, Tafel 70.