لعب خافيير أكينو خلال مسيرته الاحترافية مع 5 أندية في ثلاثة عشر موسمًا وسجل خلالها 31 هدفًا ضمن 318 مباراة. حيث فاز في موسم واحد بالكأس وفي أربعة مواسم بالدوري.
خاض خافيير أكينو مسيرته مع Cruz Azul Hidalgo [الإنجليزية] في موسم 2008–09 ولمدة موسمين، مشاركًا في 48 مباراة سجل خلالها 4 أهداف. ثم انتقل إلى نادي كروز آزول في موسم 2010–11 واستمر معه طيلة ثلاثة مواسم، حيث شارك في 69 مباراة سجل خلالها 7 أهداف. لينتقل بعدها إلى نادي فياريال في موسم 2012–13 ولمدة موسمين، مشاركًا في 44 مباراة سجل خلالها هدفًا واحدًا. ثم انتقل إلى نادي رايو فايكانو في موسم 2014–15 لمدة موسم واحد، مشاركًا في 24 مباراة ولم يسجل أي هدف. هذا وانتقل لاحقًا إلى نادي تايجرز أونال في موسم 2015–16 ليلعب معه خمسة مواسم، مشاركًا في 133 مباراة سجل خلالها 19 هدفًا.[3]