لدى العراق العديد من المناطق الحيوية والتي تشمل المناطق الجبلية من كردستان في شمال العراق والمستنقعات الرطبة على طول نهر الفرات ويضم الجزء الغربي من البلاد الصحراء وبعض المناطق شبه القاحلة. واعتباراً من عام 2001، سبعة أنواع من الثدييات و12 من نوع من الطيور أصبحت مهددة بالأنقراض. الأنواع المهددة بالانقراض تشمل أبو منجل ناسك، الأيل الأسمر الفارسي، الفهد الآسيوي. وأنقرض الحمار البري السوري[3] وأعلن أنقراض الغزال السعودي في عام 2008.
تحتوي المياه الساحلية العراقية على الشعاب المرجانية، والتي تغطي مساحة قدرها 28 كم2 في الخليج العربي، عند مصب شط العرب (29°37′00″N048°48′00″W / 29.61667°N 48.80000°W / 29.61667; -48.80000).[10] تم أكتشاف الشعاب المرجانية بواسطة غواصين البعثات العلمية المشتركة العراقية–الألمانية التي أجريت في سبتمبر / أيلول 2012 ومايو 2013. قبل اكتشافها، كان يعتقد أن العراق يفتقر إلى الشعاب المرجانية المحلية وعكرة المياه حالت دون الكشف عن احتمال وجود شعاب مرجانية محلية. وتعد واحدة من الأكثر أنواع المرجان تحملاً للبيئات في العالم، حيث أن درجة حرارة ماء البحر في هذه المنطقة يتراوح بين 14 و 34 درجة مئوية. تعيش العديد من الشعاب المرجانية في المرافئ كحجر المرجان والأوكتوكورال والأوفيورويدز وذوات الصدفتين. هناك أيضاً الديموسفنجيات التي تحتوي على السيليكا.