في عام 1961 جامعة بغداد قامت بتشكيل نادي لكرة القدم يتكون من أفضل لاعبي كرة القدم من الطلاب باسم منتخب جامعة بغداد للمنافسة في دوري الاتحاد العراقي الدرجة الثانية.[6][7] تم إقصاء الفريق في الجولة الأولى بعد خسارته 2-1 أمام نقابة عمال السكة الحديد في 22 فبراير 1961.[8] بعد ذلك، كان الفريق غير نشط حتى عام 1964 عندما شارك في بطولة الجمهورية ودخل دوري الجامعات العراقي. أول رئيس للنادي كان حسن كانه بينما تكون الطاقم الفني من المدرب غني عسكر ومساعديه الاثنين مؤيد البدريوسامي الصفار.[9]
تم تأسيس نادي الجامعة الرياضي في السابع عشر من ديسمبر 1969 ليمثل جامعة بغداد في المنافسات الرسمية. من قبل قرار خاص صدر من الاتحاد العراقي لكرة القدم كانت مشاركة النادي الأولى مباشرة في دوري الدرجة الأولى العراقي (المرتبة الثانية) دون ان يلعب في الدرجة الثانية أو الثالثة. في موسمهم الأول في 1970-71 حل النادي في المركز الأول تحت تدريب ثامر محسن مما ادى إلى ترقية النادي إلى الدوري العراقي الممتاز لكن في الموسم 1971-72 حل النادي الشاب في المركز الاخير فهبط مرة أخرى إلى الدرجة الأولى.[10]
بعد ثلاثة مواسم غادر المدرب ثامر محسن الفريق واصبح جمال صالح المدرب الجديد والذي قاد النادي إلى الترقية في موسم 1974-75 من خلال استدعاء عدد من اللاعبين من منتخب جامعة بغداد والذي تمكن من تحقيق لقب دوري جامعات العراق في نفس السنة لتدعيم قوة النادي.[9][11] في موسمهم الأول حلوا في المركز الثامن لكن في موسم 1976-77 حلوا في المركز الثاني بفارق خمس نقاط عن نادي الزوراء المتصدر.[12] في في السابع والعشرين من ديسمبر 1977، تم تأسيس نادي الطلبة الرياضي، وتم دمج نادي الجامعة مع نادي الطلبة بعد أقل من عام.[13]
في عام 1978 تمت إقالة جمال صالح من قبل مجلس الإدارة وتم استبداله بالمدرب عبد الوهاب عبد القادر والذي قاد الفريق في موسم 1978-79 والذين حلوا في المركز الثالث فيه خلف نادي الشرطة ونادي الزوراء وكان ذلك أول موسم يصل فيه لاعبي النادي إلى أول ثلاثة هدافين للدوري وهم اللاعب حسين سعيد بستة اهداف وكذلك حارس محمد بخمسة اهداف.[14] في موسم 1979-80 وتحت تدريب خلف حسن حل الطلبة مرة ثانية في المركز الثالث بسبع وعشرين نقطة وكان أهم فوزين للنادي هما امام النادي المتصدر الشرطة 2-0 في الجولة الثانية ونادي الطيران 1-0 في الجولة العشرين. اما في بطولة كأس العراق 1979-80 وصل نادي الطلبة إلى النهائي لأول مرة في تاريخه الا انه خسر في الثامن من فبراير 1980 على يد نادي الجيش عن طريق ضربات الترجيح 4-2 بعد ان تعادل الفريقان 1-1.[15]
^هاشم, رفل (19 مايس 2002). "العراق 1975/76". RSSSF (بالإنكليزية). Archived from the original on 28 نوفمبر 2017. {{استشهاد ويب}}: تحقق من التاريخ في: |تاريخ= (help)صيانة الاستشهاد: لغة غير مدعومة (link)
^هاشم, رفل (26 مايس 2002). "العراق 1979/80". RSSSF (بالإنكليزية). Archived from the original on 17 ديسمبر 2017. {{استشهاد ويب}}: تحقق من التاريخ في: |تاريخ= (help)صيانة الاستشهاد: لغة غير مدعومة (link)
