وفقًا للترتيبات والتفويضات الصادرة عن مجلس الدولة. يتولى المكتب مسؤولية الاستعدادات ذات الصلة للمفاوضات والاتفاقيات مع ما يسميه البر الرئيسي للصين «سلطات تايوان» (أي حكومة جمهورية الصين والمنظمات الحكومية المعتمدة التابعة لها). تدير الوكالة وتنسيق الروابط المباشرة في البريد والنقل والتجارة عبر مضيق تايوان. وتتولى مسؤولية وسائل الإعلاموالدعاية المتعلقة بجمهورية الصين. وتراقب وتصدر الأخبار والمعلومات المتعلقة بشؤون المنطقة الحرة. وتعالج الحوادث الكبرى المتعلقة بشؤون المنطقة الحرة. جمهورية الصين.[1]
مجلس شؤون تايوان مسؤول عن التنسيق مع التخطيط الشامل للعلاقات الاقتصادية والتجارة المتعلقة بتايوان والتبادلات والتعاون في مجالات مثل التمويل والثقافة والبحث الأكاديمي والرياضة والعلوم والتكنولوجياوالصحة وغيرها مع الإدارات المعنية.. كما يدير تبادل الأفراد والملاحظات والندوات بين الجانبين والأعمال ذات الصلة بشأن المؤتمرات الدولية التي تشارك فيها جمهورية الصين.
مسؤولو مكتب شؤون تايوان أعضاء في اللجنة المركزية للحزب الشيوعي الصيني ومكتب مهام تايوان في نفس الوقت. يتم استخدام العنوان الأخير عند التعامل مع المسؤولين في المنطقة الحرة على أساس طرف إلى طرف.