NCU terdiri dari delapan fakultas yaitu Ilmu Bumi, Teknik Elektro dan Ilmu Komputer, Teknik, Studi Hakka, Ilmu dan Teknologi Kesehatan, Seni Liberal, Sains, dan Manajemen. Setiap fakultas memiliki banyak pusat penelitian, seperti Pusat Penelitian Luar Angkasa & Penginderaan Jauh, Mitigasi & Pencegahan Bencana, Pengembangan Ekonomi Taiwan, Bioteknologi & Teknik Biomedis, dan beberapa pusat humaniora. Secara total, keseluruhan fakultas berisi 19 departemen program sarjana, 48 lembaga pascasarjana, dan 38 pusat penelitian.[butuh rujukan]