Modifikasi histon

Modifikasi histon adalah serangkaian perubahan yang dialami oleh protein histon. Modifikasi histon yang umumnya dijumpai berupa metilasi, asetilasi, dan fosforilasi. Selain tiga modifikasi tersebut, terdapat beberapa modifikasi lain seperti deiminasi, penambahan gugus β-N-asetilglukosamin, ribosilasi ADP, ubikitinasi, dan sumoilasi.[1] Modifikasi pada protein ini merupakan salah satu subyek studi epigenomika dan ditemukan mempengaruhi ekspresi gen pada eukariota.

Tata Nama

Modifikasi pada histon memiliki tata cara penamaan khusus. Umumnya penamaan ini didasarkan pada tata cara penamaan Brno yang telah disepakati oleh konsorsium laboratorium Eropa. Penamaan Brno diambil dari nama kota di Republik Ceko tempat disepakatinya penamaan tersebut.[2][3] Pengaturannya dapat disederhanakan menjadi:

NAMAFAMILI.NOMORPARALOG.SUBTIPE.VARIASIPISAHPOSISIASAMAMINOTIPEMODIFIKASI.

Penulisan modifikasi dimulai dengan menyebut gelongan dari histon yang termodifikasi (H2A, H2B, H3 and H4, dan histon pentaut H1) dilanjutkan dengan tipe paralog berdasarkan urutan penemuan (1,2,3,4, dan seterusnya), kemudian subtipe jika ada, dan variasi pisah (splice variant), jika ada. Selanjutnya dilanjutkan dengan kode asam amino dan posisinya pada rantai protein histon. Terakhir, jenis modifikasi. Jenis modifikasi dapat diperpanjang dengan menggabungkan beberapa jenis modifikasi lain menjadi satu. Sebagai contoh, H3K27me3 berarti modifikasi berupa trimetilasi (me3) pada famili histon H3, pada asam amino ke-27 (K27).

Urutan asam amino dihitung berdasarkan hasil pengutasan protein (sequencing) dan tidak dihitung berdasarkan kerangka bacaan terbuka (open reading frame) gen histon. Sebagai contoh, histon H3.3 pada manusia memiliki posisi lisina pada urutan ke-10 jika diurut berdasarkan kerangka bacaan terbuka. Namun, pada umumnya metionina pada urutan asam amino dibuang apabila diikuti dengan alanina sebagaimana yang terjadi pada histon H3.3. Oleh sebab itu urutan lisina menjadi mundur sebanyak satu urutan dari 10 menjadi 9 sehingga modifikasi pada posisi ini ditulis sebagai H3.3K9.

Grup Modifikasi 
  Asam amino termodifikasi

  Tingkat modifikasi

  Singkatan

  Contoh Penamaan

  Asetil-

  Lisina

  mono-

  ac

  H3K9ac

  Metil-

  Arginina

  mono-

  me1

  H3R17me1


  Arginina

  di-, simetris

  me2s

  H3R2me2s


  Arginina

  di-, asimetris

  me2a

  H3R17me2a


  Lisina

  mono-

  me1

  H3K4me1


  Lisina

  di-

  me2

  H3K4me2


  Lisina

  tri-

  me3

  H3K4me3

  Fosforil-

  Serina or treonina

  mono-

  ph

  H3S10ph

  Ubikitil-

  Lisina

  mono-

  ub1

  H2BK123ub1

  Sumoylil-

  Lisina

  mono-

  su

  H4K5su

  ADP ribosil-

  Glutamat

  mono-

  ar1

  H2BE2ar1


  Glutamat

  poli-

  arn

  H2BE2arn

Kode Histon

Beberapa modifikasi seperti H3K27me3 berasosiasi dengan peredaman gen. Sedangkan modifikasi lain seperti H3K4me3 berasosiasi dengan kenaikan ekspresi gen.[4] 

   Kode Histon

   Peran Biologis

   H3R2me2a

   aktivasi gen

   H3T3ph

   mitosis

   H3K4ac

   aktivasi gen

   H3K4me1, me2, me3

   aktivasi gen

   H3R8me2s

   represi gen

   H3K9ac

   aktivasi gen

   H3K9me1, me2, me3

   represi gen

   H3S10ph

   mitosis

   H3S11ph

   mitosis

   H3K14ac

   aktivasi gen

   H3R17me2a

   aktivasi gen

   H3K18ac

   aktivasi gen

   H3K23ac

   aktivasi gen

   H3R26me2a

   aktivasi gen

   H3K27ac

   aktivasi gen

   H3K27me1, me2, me3

   represi gen

   H3S28ph

   mitosis

   H3K36me1, me2, me3

   aktivasi gen

   H3K56ac

   aktivasi gen

   H3K79me1, me2, me3

   aktivasi gen

   H4S1ph

   mitosis

   H4R3me2a

   aktivasi gen

   H4R3me2s

   represi gen

   H4K5ac

   aktivasi gen

   H4K8ac

   aktivasi gen

   H4K12ac

   aktivasi gen

   H4K16ac

   aktivasi gen

   H4K20me1, me2, me3

   aktivasi gen

   H4K91ac

   aktivasi gen

   H2AS1ph

   mitosis

   H2AK4ac

   aktivasi gen

   H2AK5ac

   aktivasi gen

   H2AK7ac

   aktivasi gen

   H2AT119ph

   mitosis

   H2AK126su

   represi gen

   H2AK119ub

   aktivasi gen

   H2AS129ph

   Reparasi DNA

   H2BK5ac

   aktivasi gen

   H2BS10ph

   apoptosis

   H2BK12ac

   aktivasi gen

   H2BS14ph

   apoptosis

   H2BK15ac

   aktivasi gen

   H2BK16ac

   aktivasi gen

   H2BK20ac

   aktivasi gen

   H2BS33ph

   aktivasi gen

   H2BK120ub

   meiosis

Referensi

  1. ^ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3193420/
  2. ^ http://www.epigeneticsandchromatin.com/content/5/1/7
  3. ^ http://www.nature.com/nsmb/journal/v12/n2/full/nsmb0205-110.html
  4. ^ Allis, C.D., Jenuwein, T., Reinberg, D. (2007). Epigenetics. Plainview, NY. Cold Spring Harbor Laboratory Press

Read other articles:

سفر حجي

سفر حجيمعلومات عامةجزء من أسفار الأنبياء الصغار الاسم المختصر Hag (بالألمانية) العنوان חַגַּי (بالhbo) النوع الفني prophetic books (en) المُؤَلِّف حجاي لغة العمل أو لغة الاسم العبرية entry in abbreviations table Haggai[1] لديه جزء أو أجزاء Haggai 2 (en) Haggai 1 (en) سفر صفنيا سفر زكريا تعديل - تعديل مصدري - تعدي

 

Сейсса

СейссаCeyssat Країна  Франція Регіон Овернь-Рона-Альпи  Департамент Пюї-де-Дом  Округ Іссуар Кантон Рошфор-Монтань Код INSEE 63071 Поштові індекси 63210 Координати 45°45′59″ пн. ш. 2°53′50″ сх. д.H G O Висота 757 - 1410 м.н.р.м. Площа 30,17 км² Населення 691 (01-2020[1]) Густота 21,78 о...

 

Боротьба на літніх Олімпійських іграх 2012 — греко-римська боротьба, до 66 кг

греко-римська боротьба до 66 кгна XXX Олімпійських іграх Місце проведенняВиставковий центр Лондона, Ньюгем, ЛондонДати7 серпня 2012Учасників19 з 19 країнПризери  Кім Хьон У  Південна Корея Тамаш Лерінц  Угорщина Манучар Цхадая  Грузія Стів...

Happiness (The Blue Nile song)

1996 single by The Blue NileHappinessSingle by The Blue Nilefrom the album Peace at Last Released1996Length4:39 (album version)4:28 (single version)LabelWarnerSongwriter(s)Paul BuchananProducer(s)The Blue NileThe Blue Nile singles chronology Saturday Night (1991) Happiness (1996) Sentimental Man (1996) Happiness is a song by Scottish band The Blue Nile, which was released in 1996 as the lead single from their third studio album Peace at Last. It was written by Paul Buchanan and produced by th...

 

Футбол для дружби

Футбол для дружби (англ. Football for Friendship) — щорічна міжнародна дитяча соціальна програма, яку реалізує ПАТ «Газпром». Мета програми — через футбол прищепити молодому поколінню актуальні цінності та інтерес до здорового способу життя[1]. У рамках програми футболісти віко

 

Administrasi Bahá'í

Bagian dari seri tentangAgama Baháʼí Tokoh Utama Bahá'u'lláh Sang Báb 'Abdu'l-Bahá Shoghí Effendí Dasar Ajaran Tuhan itu satu Manusia itu satu Agama itu satu Hukum Ibadah Penanggalan Puasa Teks Keagamaan Kitáb-i-Aqdas Kitáb-i-Íqán Kalimat Tersembunyi Tulisan-tulisan Bahá'í Lembaga Administrasi Baháʼí Lembaga Perwalian Balai Keadilan Sedunia Majelis Rohani Sejarah Sejarah Bahá'í Linimasa Bahá'í Bábisme Persekusi Tokoh Lainnya Rasul Tangan Agama Tuhan Táhirih Situs dan T...

Oekraïens voetbalelftal

Oekraïens voetbalelftal kan verwijzen naar: Oekraïens voetbalelftal (mannen) Oekraïens voetbalelftal (vrouwen) Oekraïens voetbalelftal onder 21 (mannen) Bekijk alle artikelen waarvan de titel begint met Oekraïens voetbalelftal of met Oekraïens voetbalelftal in de titel. Dit is een doorverwijspagina, bedoeld om de verschillen in betekenis of gebruik van Oekraïens voetbalelftal inzichtelijk te maken. Op deze pagina staat een uitleg van de verschillende betekeniss...

 

James Rado

American dramatist (1932-2022) James RadoBornJames Alexander Radomski(1932-01-23)January 23, 1932Los Angeles, California, U.S.DiedJune 21, 2022(2022-06-21) (aged 90)New York City, U.S.Alma materUniversity of Maryland, College ParkThe Catholic University of AmericaOccupation(s)Actor, playwright, director, writer, composerNotable workHair James Alexander Radomski (January 23, 1932 – June 21, 2022),[1] known professionally as James Rado, was an American actor, playwright, dir...

 

Piedmont Park

Urban park in Atlanta, Georgia Piedmont ParkPiedmont Park's Lake Clara Meer with Midtown skyline in the backgroundTypeMunicipalLocationAtlanta, GeorgiaCoordinates33°47′10″N 84°22′24″W / 33.78611°N 84.37333°W / 33.78611; -84.37333Area189 acres (76 ha)Created1895OpenAll yearU.S. National Register of Historic Places 1887 Piedmont ExpoArchitectJoseph Forsyth Johnson; John Charles Olmsted; Frederick Law Olmsted Jr.NRHP reference No.76000629 [1...

Ravi Shankar: In Celebration

1996 compilation album by Ravi ShankarRavi Shankar: In CelebrationCompilation album by Ravi ShankarReleasedFebruary 1996 (US) July 1996 (UK)Recorded1957–1995GenreIndian classical music, jazz, world musicLength4:39:24LabelAngel, Dark HorseProducerRichard Bock, George Harrison, Peter Baumann, Ravi Shankar, Christopher Bishop, John Mordler, Kurt Munkacsi, John Fraser, Alan Kozlowski, Shefali Nag, Frank Serafine, Sukanya ShankarCompilerGeorge Harrison, Alan Kozlowski Ravi Shankar: In Ce...

 

List of NCAA Division I conference changes before 2010

See also: List of NCAA Division I conference changes since 2010 National Collegiate Athletic Association logo NCAA Division I conference realignment refers to changes in the alignment of college or university athletic programs from one National Collegiate Athletic Association athletic conference to another. 2009–2010 School Sport(s) Former Conference New Conference Air Force Falcons Men's lacrosse GWLL ECAC Lacrosse Albany Great Danes Women's golf America East MAAC Bellarmine Knights Men's ...

 

Jeff Fatt

Australian musician and actor Jeff FattAMFatt in 2007Background informationBirth nameJeffrey Wayne FattBorn (1953-07-21) 21 July 1953 (age 70)Casino, New South Wales, AustraliaGenresChildren'srockOccupation(s)MusicianactorInstrument(s)KeyboardaccordionvocalsYears active1981–presentFormerly of The Cockroaches The Wiggles Chinese nameTraditional Chinese關偉剛Simplified Chinese关伟刚[1]TranscriptionsStandard MandarinHanyu PinyinGuān WěigāngYue: CantoneseJyutpingGwaan...

American Pastime (film)

2007 American filmAmerican PastimeDVD coverDirected byDesmond NakanoWritten byDesmond NakanoTony KaydenProduced byTom GoraiArata MatsushimaBarry RosenbushDavid SkinnerTerry SpazekKerry Yo NakagawaStarringGary ColeAaron YooJon GriesMasatoshi NakamuraJudy OnggCinematographyMatthew WilliamsEdited byMark YoshikawaMusic byJoseph ConlanRelease date 2007 (2007) Running time105 minutesCountryUnited StatesLanguageEnglish American Pastime is a 2007 fictional film set in the Topaz War Relocation Ce...

 

Fleer

American bubble gum manufacturer Fleer/Skybox International LPTypePrivate (subsidiary of Upper Deck Company)IndustryConfectionery, collectiblesFounded1885FounderFrank H. FleerDefunctMay 31, 2005; 18 years ago (2005-05-31)FateBrand acquired by Upper Deck in 2005HeadquartersPhiladelphia, Pennsylvania, USProductsBubble gum, trading cardsOwnerMarvel Entertainment (1992-1999) The Fleer Corporation, founded by Frank H. Fleer in 1885, was the first company to successfully manufactu...

 

Marc Seifer

American author (born 1948) Marc SeiferSeifer in Serbia in 2007Born (1948-02-17) 17 February 1948 (age 75)New York City, New YorkOccupationAuthor Marc Jeffrey Seifer (born 17 February 1948) is an American author who has published books on handwriting analysis (Graphology), human consciousness and the mind, biographies of the inventor Nikola Tesla, and several works of fiction.[1] His book Wizard: The Life & Times of Nikola Tesla: Biography of a Genius has been called Serious ...

Wikipedia talk:WikiProject United States

Main pageTalkEmbassyRequested ArticlesMembersPortalRecognized contentTo doHelp Welcome to the discussion page of WikiProject United States Archives: Index 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 Old U.S. notice board archives: National, Southern, Northern Sections older than 60 days may be automatically archived by lowercase sigmabot III. Looking for Wikipedia talk:WikiProject United States in the Spanish Wikipedia? See es:Wikiproyecto discusión:Estados Unidos.¿Buscando la discus...

 

Gokul Express

Express Train in India This article has multiple issues. Please help improve it or discuss these issues on the talk page. (Learn how and when to remove these template messages) This article is an orphan, as no other articles link to it. Please introduce links to this page from related articles; try the Find link tool for suggestions. (July 2021) This article relies largely or entirely on a single source. Relevant discussion may be found on the talk page. Please help improve this article by in...

 

Aligarh Institute Gazette

Academic journalAligarh Institute GazetteLanguageUrdu, EnglishEdited bySyed Ahmed KhanPublication detailsPublisherSyed Ahmed Khan (India)FrequencyBiweeklyStandard abbreviationsISO 4 (alt) · Bluebook (alt1 · alt2)NLM · MathSciNet ISO 4Aligarh Inst. Gaz. Part of a series onAligarh Movement Notable ideas Muslim adoption of Western ideas Muslim identity Oxbridge model of education Advocacy of Urdu Notable members Sir Syed Ahmad Khan Nawab Waqar-...

Yesaya 47

Yesaya 47Gulungan Besar Kitab Yesaya, yang memuat lengkap seluruh Kitab Yesaya, dibuat pada abad ke-2 SM, diketemukan di gua 1, Qumran, pada tahun 1947.KitabKitab YesayaKategoriNevi'imBagian Alkitab KristenPerjanjian LamaUrutan dalamKitab Kristen23← pasal 46 pasal 48 → Yesaya 47 (disingkat Yes 47) adalah bagian dari Kitab Yesaya dalam Alkitab Ibrani dan Perjanjian Lama di Alkitab Kristen.[1] Berisi Firman Allah yang disampaikan oleh nabi Yesaya bin Amos tentang Yehuda dan ...

 

Yesaya 55

Yesaya 55Gulungan Besar Kitab Yesaya, yang memuat lengkap seluruh Kitab Yesaya, dibuat pada abad ke-2 SM, diketemukan di gua 1, Qumran, pada tahun 1947.KitabKitab YesayaKategoriNevi'imBagian Alkitab KristenPerjanjian LamaUrutan dalamKitab Kristen23← pasal 54 pasal 56 → Yesaya 55 (disingkat Yes 55) adalah bagian dari Kitab Yesaya dalam Alkitab Ibrani dan Perjanjian Lama di Alkitab Kristen.[1] Memuat Firman Allah yang disampaikan oleh nabi Yesaya bin Amos terutama berkenaan ...

 

Strategi Solo vs Squad di Free Fire: Cara Menang Mudah!